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Visor

Tu bacteria gemela

¿Quieres saber cuál es la bacteria cuyo genoma guarda cierta relación contigo?

En deCODE, sabrás cuál y por qué. Anímate a descubrirlo.

Por Jasóm

En realidad se trata de un sencillo juego del que puedes aprender bastante. Basta con que introduzcas en la casilla que aparece en la web deCODE tu nombre y primer apellido. El programa, a continuación:

  • Cambiará las leltras de tu nombre por los nucleótidos de ADN más aproximados siguiendo la siguiente equivalencia:
Símbolo Significado Regla mnemotécnica
G G Letra inicial de “Guanina”
A A Letra inicial de “Alanina”
T T Letra inicial de “Timina”
C C Letra inicial de "Citosina”
R A ó G La R proviene de la palabra “puRina”
Y C ó T La Y proviene de la palabra en inglés “pYrimidine”
M A ó C M es contenida en el nombre del grupo aMino
K G ó T K esta contenida en el nombre en inglés del grupo “Keto”
S C ó G De la palabra en inglés “Strong” para aludir a los 3 puentes de hidrógeno
W A ó T De la palabra en inglés “Weak” para aludir a los 2 puentes de hidrógeno
H A, C ó T La G es la única base ausente. H es la letra que sigue a G en el alfabeto
B C, G ó T La A es la única base ausente. B es la letra que sigue a A en el alfabeto
V A, C ó G La T (o la U) es la única base ausente. V es la letra que sigue a U en el alfabeto
D A, G ó T La C es la única base ausente. D es la letra que sigue a C en el alfabeto
N A, C, G ó T De la palabra “Nucleótido”
X Sin equivalencia

Como solo hay 20 aminoácidos codificados por ADN, puede que alguna letra de tu nombre no corresponda con ninguna de las letras anteriores (O, Z, J...). El programa reemplaza esa letra mediante una X, que significa "cualquier aminoácido"

  • Buscará esa secuencia de letras entre las 168.297 secuencias de proteínas pertenecientes a 8826 animales, plantas y microorganismios... Con mucha probabilidad ese organismo será una bacteria.
  • Y, finalmente, te dará el nombre de la proteína a la que esa secuencia de ADN daría lugar en ese organismo... ¡a partir de las letras de tu nombre!

sabías que...Ten en cuenta que esto no tiene una base científica, sino un juego para que conozcas que:

  • Las proteínas de una especie están codificadas en su ADN, en un código de 4 letras o nucleótidos: A, C. T, G
  • El ADN está en el núcleo celular.
  • Que combinando esas 4 letras puedes obtener cualquier proteína
  • Estas secuencias de ADN que codifiican para proteínas son los genes.
  • Los ribosomas son las estructuras celulares encargadas de "leer" la información de los genes (a partir de una copia de los mismos en forma de otra molécula, el ARN, y producir una proteína.

En mi caso,

  • Mi nombre en ADN seria: NNNGCCGTGATCGAGAGAATGGAGGACATCAACGCC
  • Esta secuencia de ADN es similar a la que produciría la  proteína Q8YJB8|FTSK_BRUME.
  • Esta proteína aparece en la bacteria Brucella melitensis, una bacteria que afecta fundamentalmente a cabras y ovejas, pero puede afectar a bóvidos y cerdos y que es responsable de la gran mayoría de los casos de fiebres de malta o brucelosis en España, ocasionando además los de mayor gravedad. Esta proteína, en concreto, juega un importante papel en la bacteria, al ser responsable de la división bacteriana y de la separación correcta de los cromosomas.


Y esta seria la secuencia en aminoácidos de esa proteína:


MRQGYSPSYPLRDERITEDRLRFANLVRRQVYILLGLGLLSLTAMAVGALATWNVADPSF
SHATDNPVTNALGYPGAVFSDLAMQFFGLASVPALLPLAVWSLLLMIRGYIGRIARRSLA
WVGAALLFAAIASCFAVPQSWPMPIGLGGVFGDMLLRIPGFFLGGFPQGAIASAIALVLA
FPALWFCFFASGIIGRGAEAVNPAMLSANRSADDEFADEDADNEAGGGFHFIGALTHLVL
MTTATIRRMTGLGRRRSREDDFDDMRMVRRSAETRNAPPPRARKARVEQTAPSPKPGPRA
QREAQPSFLKDNGIFEMPSLHFLAEPKLVQRDPALSKDALEQNARLLAGVLEDFGVRGEI
INVKPGPVVTLYELEPAPGIKSSRVIGLADDIARSMSAIAARVAVIPGRNAIGIELPNPK
REMVYLREMLASRDFEQSKAKLALALGKTINGEPVIADIAKMPHVLVAGTTGSGKSVAIN
TMILSLLYRMTPQECRLIMIDPKMLELSVYDGIPHLLTPVVTDPKKAVVALKWTVREMED
RYRKMSKVGVRNIDGFNQRVGLAQKKGEPIARTVQTGFDRNTGEAIYETEELDLEPMPYI
VVIIDEMADLMMVAGKDIEGAVQRLAQMARAAGIHVIMATQRPSVDVITGTIKANFPTRI
SFQVTSKIDSRTILGEQGAEQLLGQGDMLFMAGGGRIQRVHGPFVGDDEVERIVQHLKLQ
GVPEYLDAITEDEDDDEGGSGPAGTGNLEDSDDPYDQAVAVVLRDKKASTSYIQRRLGIG
YNRAASIIERMEDEGIVGPANHAGKREILVPTGDDDF

 


Como ves, un sencillo juego dle que puedes aprender mucho.